Το Κέντρο Επιχειρήσεων (Κ.ΕΠΙΧ.) αποτελεί κομβικό γραφείο του Οργανισμού για την εξασφάλιση της διαρκούς και ομαλής λειτουργίας του. Οι βασικές λειτουργίες του είναι η λήψη και η επεξεργασία πληροφοριών που σχετίζονται με θέματα δημόσιας υγείας αλλά και η διαχείριση και η εκτίμηση κινδύνου, οξέων και άλλων συμβάντων Δημόσιας Υγείας. Οι πληροφορίες και τα αιτήματα στο Κ.ΕΠΙΧ προέρχονται από:
Το προσωπικό του Κ.ΕΠΙΧ διαθέτει μεγάλη εμπειρία και εκπαίδευση σε θέματα ανάπτυξης σχεδίων και μνημονίων διαχείρισης και αντιμετώπισης συμβάντων που αφορούν στην Δημόσια Υγεία και προέρχονται από γνωστούς παθογόνους μικροοργανισμούς, από νεοαναδυόμενα νοσήματα είτε από ηθελημένη απελευθέρωση παραγόντων. Σημαντική είναι η εμπειρία του προσωπικού του Κ.ΕΠΙΧ από την συμμετοχή του σε ασκήσεις επί χάρτου σε Ευρωπαϊκό Επίπεδο.
Στις δράσεις του ανήκει και η συνεργασία με την τηλεφωνική γραμμή για το κάπνισμα 1142 καθώς και με την τηλεφωνική γραμμή για το AIDS 210-7222222.
Το Γραφείο Εκτίμησης Κινδύνου και Αντιμετώπισης οξέων συμβάντων δημόσιας υγείας ανήκει στο Κ.ΕΠΙΧ. Διαθέτει μεγάλη εμπειρία και εξειδίκευση σε θέματα που αφορούν περιστατικά ηθελημένης απελευθέρωσης βιολογικών παραγόντων, η οποία αποχτήθηκε ιδιαίτερα κατόπιν εκπαιδεύσεων του προσωπικού του γραφείου κατά την διάρκεια των Ολυμπιακών Αγώνων του 2004. Βασικές δράσεις του γραφείου είναι:
Απευθύνεται σε επαγγελματίες υγείας, σε πολίτες που ενδιαφέρονται να ενημερωθούν για θέματα που αφορούν στα λοιμώδη νοσήματα αλλά και για λοιπά θέματα δημόσιας υγείας, σε φορείς του Δημοσίου και Ιδιωτικού Τομέα, όπως Διευθύνσεις Υγείας των Νομαρχιών, Νοσοκομεία, Κέντρα Υγείας, ιδιωτικές κλινικές, αλλά και σε άλλους φορείς και ινστιτούτα όπως Περιφέρειες, ΓΓΠΠ, ΕΛΑΣ, ΠΥ, κ.ά.
Οι κλήσεις απαντώνται από γιατρούς ή νοσηλευτές και ειδικευμένο διοικητικό προσωπικό. Η τηλεφωνική επικοινωνία με το επιστημονικό προσωπικό του Κ.ΕΠΙΧ. δεν αντικαθιστά τον κλινικό και εργαστηριακό έλεγχο, αλλά συνιστά την αντιμετώπιση των περιστατικών στα πλαίσια της Δημόσιας Υγείας.