Η λοίμωξη από arbo-ιούς μπορεί να είναι ασυμπτωματική ή μπορεί να προκαλέσει νόσηση ποικίλης βαρύτητας, που ορισμένες φορές αφορά το κεντρικό νευρικό σύστημα (ΚΝΣ). Όταν προσβάλλεται το ΚΝΣ, μπορεί να εμφανιστούν κλινικά σύνδρομα που κυμαίνονται από εμπύρετη κεφαλαλγία έως άσηπτη μηνιγγίτιδα και εγκεφαλίτιδα, τα οποία δεν μπορούν να διακριθούν από αυτά που προκαλούνται από άλλους ιούς. Η εγκεφαλίτιδα από arbo-ιούς χαρακτηρίζεται από πυρετό, κεφαλαλγία, διαταραχή της συνείδησης (από σύγχηση έως κώμα), με ή χωρίς πρόσθετες εκδηλώσεις εγκεφαλικής δυσλειτουργίας (π.χ. παράλυση, διαταραχές της αισθητικότητας, παθολογικά αντανακλαστικά, γενικευμένοι σπασμοί κ.ά.).
Κρούσμα με συμβατή κλινική εικόνα και θετικά εργαστηριακά ευρήματα για πιθανό κρούσμα (βλέπε παραπάνω).
Κρούσμα με συμβατή κλινική εικόνα, το οποίο έχει επιβεβαιωθεί εργαστηριακά.