Οι στόχοι της επιδημιολογικής επιτήρησης των λοιμωδών νοσημάτων είναι:
Η επιδημιολογική επιτήρηση γίνεται κυρίως μέσω των 3 συστημάτων επιτήρησης (βλ. παρακάτω), ενώ συμπληρωματικό ρόλο στην επιτήρηση παίζουν ειδικά συστήματα.
Σύστημα Υποχρεωτικής Δήλωσης Σύστημα Παρατηρητών Νοσηρότητας (Sentinel) Ειδικά Συστήματα Επιτήρησης / Δήλωσης Κρουσμάτων